什么是慢日志？
MySQL的慢查询日志是MySQL提供的一种日志记录，它用来记录在MySQL中响应时间超过阀值的语句，具体指运行时间超过long_query_time值的SQL，则会被记录到慢查询日志中。long_query_time的默认值为10，意思是运行10S以上的语句。默认情况下，MySQL数据库并不启动慢查询日志，需要我们手动来设置这个参数，当然，如果不是调优需要的话，一般不建议启动该参数，因为开启慢查询日志会或多或少带来一定的性能影响。慢查询日志支持将日志记录写入文件，也支持将日志记录写入数据库表。
参考文档：
什么情况下产生慢日志？
看图说话，有很多开关影响着慢日志的生成，相关的参数后面会挨个说明。从上图可以看出慢日志输出的内容有两个，第一执行时间过长（大于设置的long_query_time阈值）；第二未使用索引，或者未使用最优的索引。这两种日志默认情况下都没有打开，特别是未使用索引的日志，因为这一类的日志可能会有很多，所以还有个特别的开关log_throttle_queries_not_using_indexes用于限制每分钟输出未使用索引的日志数量。
慢日志相关参数
以上应该是最完整的和慢日志相关的所有参数，大多数参数都有前置条件，所以在使用的时候可以参照上面的流程图。5.6官方文档：
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/server-system-variables.html
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/server-options.html
慢日志输出内容
第一行：标记日志产生的时间，准确说是SQL执行完成的时间点，改行记录每一秒只打印一条；
第二行：客户端的账户信息，两个用户名（第一个是授权账户，第二个为登录账户），客户端IP地址，还有mysqld的线程ID；
第三行：查询执行的信息，包括查询时长，锁持有时长，返回客户端的行数，扫描行数。通常我需要优化的就是最后一个内容，尽量减少SQL语句扫描的数据行数。
第四行：通过代码看，貌似和第一行的时间没有区别。
第五话：最后就是产生慢查询的SQL语句；
--log-short-format=true：
如果mysqld启动时指定了--log-short-format参数，则不会输出第一、第二行。
log-queries-not-using-indexes=on
log_throttle_queries_not_using_indexes > 0 :
如果启用了以上两个参数，每分钟超过log_throttle_queries_not_using_indexes配置的未使用索引的慢日志将会被抑制，被抑制的信息会被汇总，每分钟输出一次。格式如下：
# Time: 170526 11:26:10
# User@Host: [] @ [] Id: 38
# Query_time: 0.021872 Lock_time: 0.008620 Rows_sent: 0 Rows_examined: 0
SET timestamp=1495769170;
throttle: 14 'index not used' warning(s) suppressed.;
慢日志分析工具
- 官方自带工具： mysqldumpslow
- 开源工具：mysqlsla
- percona-toolkit：工具包中的pt-query-digest工具可以分析汇总慢查询信息，具体逻辑可以看SlowLogParser这个函数；
慢日志的清理与备份
删除：直接删除慢日志文件，执行flush logs（必须的）;
备份：先用mv重命名文件（不要跨分区），然后执行flush logs（必须的）；
另外修改系统变量slow_query_log_file也可以立即生效；
执行flush logs，系统会先close当前的句柄，然后重新open；mv , rm日志文件系统并不会报错，具体的原因可以Google下linux i_count i_nlink ；